ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO GENÔMICA AMPLA PARA INTERAÇÃO de C. arabica e Pseudomonas syringae pv. garcae

Caroline Ariyoshi, Gustavo César Sant'ana, Gustavo Hiroshi Sera, Lucas Mateus Rivero Rodrigues, Lívia Maria Nogueira, Rafaelle Vicchia Ferreira, Mariane Silva Felício, Bruna Silvestre Rodrigues da Silva, Fernanda Freitas de Oliveira, Larissa Girotto, Suzana Tiemi Ivamoto, Douglas Silva Domingues, Luiz Filipe Protasio Pereira

Resumo


O objetivo deste trabalho foi explorar os recursos genéticos de genótipos de C. arabica do centro de origem para identificar regiões genômicas associadas à resistência a mancha aureolada. Para isto, 101 genótipos de C. arabica da coleção da Etiópia FAO e 11 cultivares foram sequenciados e genotipados através da técnica de genotipagem por sequenciamento (GBS). O GBS resultou em 6.210.920 tags que foram alinhadas ao genoma de C. arabica e resultou na identificação de 10.650 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). O mesmo material vegetal também foi avaliado fenotipicamente para resistência a mancha aureolada, causada pela Pseudomonas syringae pv. garcae. A fenotipagem varia entre altamente imune à altamente suscetível. Com esses dados, utilizando o programa FASTmrEMMA foi feito um Estudo de Associação Genômica Ampla. Como resultado, 5 SNPs, com alto potencial para Seleção Assistida, foram associados à resistência a mancha aureolada. Além disso, foi possível identificar genes próximos aos SNPs relacionados ao mecanismo de defesa das plantas. Entre esses estão genes que codificam as proteínas serina/treonina quinase e a CC-NB-LRR.


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