ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO GENÔMICA AMPLA PARA INTERAÇÃO de C. arabica e Pseudomonas syringae pv. garcae
Resumo
O objetivo deste trabalho foi explorar os recursos genéticos de genótipos de C. arabica do centro de origem para identificar regiões genômicas associadas à resistência a mancha aureolada. Para isto, 101 genótipos de C. arabica da coleção da Etiópia FAO e 11 cultivares foram sequenciados e genotipados através da técnica de genotipagem por sequenciamento (GBS). O GBS resultou em 6.210.920 tags que foram alinhadas ao genoma de C. arabica e resultou na identificação de 10.650 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). O mesmo material vegetal também foi avaliado fenotipicamente para resistência a mancha aureolada, causada pela Pseudomonas syringae pv. garcae. A fenotipagem varia entre altamente imune à altamente suscetível. Com esses dados, utilizando o programa FASTmrEMMA foi feito um Estudo de Associação Genômica Ampla. Como resultado, 5 SNPs, com alto potencial para Seleção Assistida, foram associados à resistência a mancha aureolada. Além disso, foi possível identificar genes próximos aos SNPs relacionados ao mecanismo de defesa das plantas. Entre esses estão genes que codificam as proteínas serina/treonina quinase e a CC-NB-LRR.
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