DESENVOLVIMENTO DE UM MÉTODO MOLECULAR PARA A IDENTIFICAÇÃO DE VARIEDADES CLONAIS DE Coffea canephora POR MEIO DE PCR

Resumo

O café Conilon, espécie Coffea canephora, é uma planta perene, diploide (2n = 2× = 22), alógama, resultando em alta variabilidade genética. Desta forma, a lavoura quando formada a partir de sementes pode resultar em plantas com características muito discrepantes. Neste cenário, a produção de mudas é de grande valia para que a lavoura seja implantada de forma homogênea. Uma variedade clonal, com mudas provenientes de um trabalho prévio de seleção de plantas matrizes, apresentam as seguintes vantagens em relação à de sementes: menor custo de implementação, maior produtividade, maior uniformidade de maturação, melhor qualidade do grão, ciclo diferenciado de maturação e programação escalonada de colheita, proporcionando sucesso na formação da lavoura. O Brasil é um importante produtor de café e o desenvolvimento de novas variedades faz-se necessário para manter e/ou aumentar sua eficiência na produção. A legislação brasileira regulamenta a comercialização de novas sementes e mudas no mercado, e que envolve os conceitos de registro e proteção de cultivares. A Lei no 10.711, de 05 de agosto de 2003 e a Lei no 9.456, de 25 de abril de 1997 e suas regulamentações dispõem sobre o Sistema Nacional de Sementes e Mudas e institui o direito de proteção de cultivares respectivamente. O registro de uma cultivar, no Registro Nacional de Cultivares permite a produção, o beneficiamento e a comercialização de sementes e mudas; Por outro lado, a proteção da cultivar no Serviço Nacional de Proteção de Cultivares dá o direito à propriedade intelectual ao seu obtentor. Este registro e/ou proteção são baseados apenas em características morfológicas, sendo que o melhorista responsável pelo desenvolvimento da variedade assegura a descrição, fato este, que pode não ser preciso no diagnóstico precoce dos clones, visto que as características morfológicas só podem ser analisadas após o desenvolvimento da planta. Desta forma, o objetivo do presente trabalho visou desenvolver um método molecular que pode ser utilizado para a identificação de variedades clonais de C. canephora, registradas e/ou protegidas no Brasil. Os clones componentes dessas variedades clonais, foram genotipados utilizando-se a plataforma Coffee Axiom chip – 26K  desenvolvido pela Embrapa, a partir do genoma de referencia, contendo cerca de 25 mil SNPs (Single Nucleotide Polymorphism)Como resultado desta genotipagem foram obtidos 25.456 SNPs, destes 22.889 marcadores (89,88%) foram classificados com alta resolução, dos quais 20.424 (80,23%) foram polimórficos para o conjunto de indivíduos das variedades analisadas. Os SNPs foram analisados e 8 deles foram selecionados para serem possíveis candidatos no uso da distinção alélica para a possível identificação dos clones de Conilon que compõem as variedades registradas e/ou protegidas no Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (2017).