Validação de sequências candidatas de silenciamento gênico de Meloidogyne incognita.

Resumo

Meloidogyne incognita, root-knot nematode (RKN), é um dos patógenos mais prejudiciais na agricultura mundial e devastadores em cafezais. Programas de melhoramento genético visando a introgressão de genes R tem resultado em quebra de resistência. A maior parte dos defensivos químicos tem se mostrado ineficientes no controle desta praga, bem como as tentativas de controle biológico. Em trabalhos anteriores foi observado que genes homólogos a miraculina foi suerexpresso em raízes de cafeeiro de genótipo resistente entre 5 e 6 dias após a infecção por RKN. Foram sequenciadas amostras de raízes por Illumina HiSeq 4000, gerando mais de 800 milhões de reads de 2x100 de bases. Expressão diferencial in silico e a análise do enriquecimento por GO indicam que algumas famílias gênicas são fortemente diferencialmente expressas em respostas resistentes à infecção. 14 genes superexpressos da superfamília de inibidores de proteinases tipo Kunitz similares à Miraculina foram identificados. A evidência até o momento de que a miraculina está fortemente ligada à resposta imune da planta ao RKN, pois a CoMir foi superexpressa em resposta a infecção por bicho mineiro do cafeeiro (Leocoptera coffeella). Este estudo mostra a análise de expressão de genes tipo Miraculina por qPCR tempo real em raízes de cafeeiro, e a correlação dessa expressão com estresses bióticos na resposta a estresses da planta. Esses genes podem ser importantes atores na resposta imune da planta, podendo ser potencialmente utilizados em abordagens de desenvolvimento de controle de nematoides e pragas.